教育经历

2004.09 – 2008.07，兰州大学 数学与应用数学专业 理学学士；

2008.09 – 2012.12，兰州大学 生态学 理学博士。

工作经历

2013.01 – 2015.06， 四川大学 博士后；

2013.02 – 2015.06，四川大学 讲师；

2015.07 – 2020.12， 中国科学院西双版纳热带植物园 副研究员；

2016.11– 至今，中国科学院西双版纳热带植物园 植物进化生态学研究组组长；

2021.01 – 至今，中国科学院西双版纳热带植物园 研究员。

社会兼职

2019.04 – 至今，Associate Editor of Plant Ecology & Diversity, Journal of the Botanical Society of Scotland

主要学术成绩

（1）杂交阻碍种群分化是一条进化生物学常识。基于对云杉属植物基因组数据的解析，提出并论证了杂交可帮助种群分化的新观点。

（2）中性进化理论认为随机漂变是分子进化的基本机制。基于对栗属物种起源过程的研究，发现生殖隔离位点的非随机分布式样，揭示出自然选择与遗传重组的互作是基因组进化的新机制。

（3）设计完成国内第一例裸子植物群体基因组学研究，并发现油麦吊云杉适应干旱环境的候选遗传因子。

（4）发现首个二倍体树木杂交物种形成类群，并提出一个物种形成新机制，即亲本生殖隔离位点的重新组合。

（5）发表新方法、新假说、新物种若干。

科技奖励

中组部与中科院优秀西部青年学者（2020）；

中科院青年创新促进会会员（2019）；

云南省云岭青年人才（2017）。

主持科研项目

（1）中国科学院战略性先导科技专项项目，XDB1080200，橡胶树全基因组选择育种，2024/10-2029/09，1469.32万，在研，主持。

（2）云南省重大科技专项计划项目课题，202402AE090019-03，产胶潜力及抗逆性全基因组选择育种技术研发，2024/01-2026/12，90万，在研，主持。

（3）中国科学院西双版纳热带植物园“十四五”新兴前沿方向和未来技术之重点任务，橡胶树全基因组选择育种技术研发及应用，2023/09-2025/12，500万，在研，主持。

（4）中国科学院稳定支持基础研究领域青年团队计划，YSBR-079，云南橡胶树种质资源退化与改良，2022/07-2027/07，2000万，在研，参加。

（5）云南省“千人计划”青年人才专项，云南省珍贵林木物种遗传多样性形成与保护，2018/01-至今，80万，在研，主持。

（6）中国科学院西双版纳热带植物园，启动研究经费，2016/11-至今，50万，在研，主持。

（7）NSFC面上项目，31971392，项目名称：丽江云杉杂交带的形成和维持机制研究， 2020/01-2023/12，69.6万，已结题，主持。

（8）中国科学院青年创新促进会项目，锥栗基因组多样性的结构与形成，任项目主持，2019/01-2022/12，80万，已结题，主持。

（9）NSFC面上项目，31670665，基于基因组重测序研究三个栗属物种的适应性分化，2017/01-2020/12，73.2万，已结题，主持。

（10）中组部与中国科学院“西部之光”人才培养引进计划（西部青年学者A类项目），板栗和锥栗的物种分化， 2017/01-2019/12，50万，已结题（获评优秀），主持

（11）NSFC青年科学基金项目，31300559，丽江云杉和青扦的种间基因流波动，2014/01-2016/12，22万，已结题，主持。

代表性论文目录（*表示通讯作者）

（1）Sun, Y.*, Lu, Z., Zhu, X., Ma, H. Genomic basis of homoploid hybrid speciation within chestnut trees. Nature Communications. 2020, 11: 3375. DOI: 10.1038/s41467-020-17111-w.

（2）Sun, Y.*, Abbott, R.J., Lu, Z., Mao, K., Zhang, L., Wang, X., Ru, D., Liu, J.* Reticulate evolution within a spruce (Picea) species complex revealed by population genomic analysis. Evolution. 2018, 72: 2669–2681.

（3）Ru, D., Mao, K., Zhang, L., Wang, X., Lu, Z., Sun, Y.*. Genomic evidence for polyphyletic origins and inter-lineage gene flow within complex taxa: a case study of Picea brachytyla in the Qinghai-Tibet Plateau. Molecular Ecology. 2016, 25: 2373–2386. 

（4）Sun, Y., Abbott, R.J., Li, L., Li, L., Zou, J., Liu, J.* Evolutionary history of Purple cone spruce (Picea purpurea) in the Qinghai–Tibet Plateau: homoploid hybrid origin and Pleistocene expansion. Molecular Ecology. 2014. 23: 343–359. 

（5）Sun Y., Li, L., Li, L., Zou, J.B., Liu, J.* Distributional dynamics and interspecific gene flow in Picea likiangensis and P. wilsonii triggered by climate change on the Qinghai-Tibet Plateau. Journal of Biogeography. 2015, 42: 475–484. 

其余署名第一或通讯作者的论文目录

（1）Sun, Y., Tian, W.,* Zhai, D., Yang, Y.* Technological bottlenecks and innovative developments for rubber tree breeding in China. Bulletin of Chinese Academy of Sciences. 39: 191–197, 2024. (in Chinese)

（2）Zhu, H., Lei, W., Lai, Q., Sun, Y.,* Ru, D.* Comparative analysis shows high level of lineage sorting in genomic regions with low recombination in the extended Picea likiangensis species complex. Plant Diversity. 46: 547–550, 2024.

（3）Wang, D.,# Sun, Y.,# Lei, W.,# Zhu, H., Wang, J., Bi, H., Feng, S., Liu, J.,* Ru, D.* Backcrossing to different parents produced two distinct hybrid species. Heredity. 131: 145–155, 2023.

（4）Tian, B., Fu, Y., Milne, R.I., Mao, K., Sun, Y.*, Ma, X., Sun, H.* A complex pattern of post-divergence expansion, contraction, introgression and asynchronous responses to Pleistocene climate changes in two Dipelta sister species from western China. Journal of Systematics and Evolution. 2020, 58: 247–262. 

（5）Bi, H., Yue, W., Wang, X., Zou, J., Li, L., Liu, J., Sun, Y.* Late Pleistocene climate change promoted divergence between Picea asperata and P. crassifolia on the Qinghai-Tibet Plateau through recent bottlenecks. Ecology and Evolution. 2016, 6: 4435–4444. 

（6）Wang, X., Li, Y., Liang, Q., Zhang, L., Wang, Q., Hu, H., Sun, Y.*. Contrasting responses to Pleistocene climate changes: A case study of two sister species Allium cyathophorum and A. spicata (Amaryllidaceae) distributed in the eastern and western Qinghai-Tibet Plateau. Ecology and Evolution. 2015, 5: 1513–1524.

（7）Sun, Y., Wang, A., Wan, D., Wang, Q., Liu, J.* Rapid radiation of Rheum (Polygonaceae) and parallel evolution of morphological traits. Molecular Phylogenetics and Evolution. 2012, 63: 150–158. 

（8）Sun, Y., Ikeda, H., Wang, Y., Liu, J.* Phylogeography of Potentilla fruticosa (Rosaceae) in the Qinghai–Tibetan Plateau revisited: A reappraisal and new insights. Plant Ecology & Diversity. 2010, 3: 249–257. 

（9）Ru, D.#, Sun, Y.#, Wang, D.#, Chen, Y., Wang, T., Hu, Q., Abbott, R.J., Liu, J.* Population genomic analysis reveals that homoploid hybrid speciation can be a lengthy process. Molecular Ecology. 2018, 27: 4875–4887. (co-first author)

（10）Yang, Y. , Li, Y., Chen, Q., Sun, Y.*, Lu, Z.* Wgddetector: a pipeline for detecting whole genome duplication events using the genome or transcriptome annotations. BMC Bioinformatics. 2019, 20(1), 75.

（11） Lu, Z., Sun, Y.* Rhamnella brachycarpa (Rhamnaceae), a new species from Hainan Island, China. PhytoKeys. 2019, 132: 19–29.

（12）Lu, X., Sun, Y.* Rhamnella intermedia (Rhamnaceae), a new evergreen species from southwest Guangxi. PhytoKeys. 2020, 159: 115–126.

（13）Zhu, X., Sun, Y.* The complete chloroplast genome of the endangered tree Parashorea chinensis (Dipterocarpaceae). Mitochondrial DNA Part B. 2019, 4: 1163–1164.

（14）Wang, D.,# Sun, Y.,# Lei, W.,# Zhu, H., Wang, J., Bi, H., Feng, S., Liu, J.,* Ru, D.* Backcrossing to different parents produced two distinct hybrid species. Heredity. 2023, 131: 145–155. 

（15） Sun, Y., Tian, W.,* Zhai, D., Yang, Y.* Technological bottlenecks and innovative developments for rubber tree breeding in China. Bulletin of Chinese Academy of Sciences. 2024, 39: 191–197. (in Chinese)

（16）Zhu, H., Lei, W., Lai, Q., Sun, Y.,* Ru, D.* Comparative analysis shows high level of lineage sorting in genomic regions with low recombination in the extended Picea likiangensis species complex. Plant Diversity. 2024, 46: 547–550.

其它成果

基因变异分析器并行近亲关系判断系统，软著登字第13044452号；

橡胶树胶乳分子量分布检测分析管理平台，软著登字第13609708号。